特殊技能的学习机制存在明确的限制条件，并非所有妖怪都能随意掌握其他妖怪的专属技能。特殊技能通常分为三类：通过升级自然习得的技能、通过技能机器（TM/HM）学习的技能，以及通过特定条件触发的技能（如招式复制或剧情奖励）。每种技能的获取方式决定了其可学习范围，部分技能确实存在跨物种学习的可能性，但需满足属性、种族或剧情进度的硬性要求。
通过技能机器学习的特殊技能具备较高的通用性，例如HM02飞翔、HM03冲浪等。这类技能允许符合条件的妖怪直接习得，但限制依然存在——只有拥有飞行属性的妖怪才能学习飞翔，而冲浪则多限于水系妖怪。技能机器的可重复使用特性使得玩家能灵活分配技能，但需注意妖怪的个体差异，例如部分地面系妖怪即使满足属性条件也可能因种族设定无法学习冲浪。
招式复制是另一种特殊技能传递方式，但触发条件较为苛刻。战斗中若敌方妖怪使用特殊技能，且己方妖怪具备学习该技能的潜在能力，则有一定概率通过模仿或写生类技能临时复制。此类方式对技能类型有限制，通常无法复制神兽专属技能或剧情限定技能。复制效果多为临时性，仅少数妖怪（如图图犬）可通过写生永久保留复制的技能。
剧情奖励或隐藏任务提供的特殊技能通常绑定特定妖怪，例如七岛任务中初始妖怪的终极技能（暴烈燃烧、高压水炮等）。这类技能具有明确的独占性，其他妖怪无法通过常规手段学习。玩家需在技能获取前规划队伍配置，避免因属性冲突或种族限制导致资源浪费。火红版的技能学习设计强调策略性，玩家需综合考量妖怪属性、技能效果及战斗需求来优化技能分配。
最后部分特殊技能虽能通过多种方式学习，但实际效果受妖怪个体数值影响较大。例如同为飞翔技能，不同妖怪使用时可能因速度或攻击力差异产生截然不同的战斗收益。这种设计进一步强化了队伍搭配的重要性，玩家需在技能泛用性与妖怪特性之间寻找平衡点。
